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Depois da volta do Talibã ao poder, eles tiveram de se esconder com medo de serem presos ou até mortos.Ativistas ouvidos pela CNN falam em centenas de pessoas LGBT tentando deixar o país por medo de perseguição.
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Os extremistas ainda não se manifestaram sobre a severidade com a qual esses grupos serão tratados em seu governo. Entretanto, em uma entrevista ao jornal alemão Bild em julho, um juiz do Talibã disse que a homossexualidade tinha apenas duas punições: o apedrejamento ou ser esmagado sob uma parede.
Há relatos de afegãos sendo estuprados por sua homossexualidade. Durante a presença militar dos Estados Unidos isso também ocorria, contudo o temor agora é que a violência contra pessoas LGBT seja incentivada pelas autoridades.